Az életrajzi források tanúsága szerint Ferenc már kora ifjúságától együtt élt különféle betegségekkel. A Perugiai legenda úgy fogalmaz: „ifjúkorától törékeny és gyönge testalkatú volt, s a világban is csak kényeztetetten élhetett volna”; más források pedig arról számolnak be, hogy halála közeledtével betegségei és gyöngesége egyre inkább elhatalmasodott rajta.